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由于异常导致的不育是导致男性不育的重要原因之，必须给予足够重视。异常性不育的男性疾病有以下几个方面：
垂体病变：垂体功能亢进，早期可出现性欲增加、体型改变等，继而便发生性欲减退、精液异常、阳痿等并导致不育。垂体功能低下，如垂体肿瘤、炎症、手术损伤或放疗破坏垂体，致使垂体功能低下，出现性欲、性交能力降低，睾丸萎缩，精子生成障碍。垂体肿瘤可使血中催乳素水平升高，干扰LH的分泌而抑制睾丸生精功能及发生阳痿，从而导致男性不育。
睾丸异常的病变：原发性睾丸功能低下，比较常见的有克莱恩弗尔特（Kline felter）综合征、放射性损伤、细胞毒素损害、营养不良等；继发性睾丸功能低下，如Kallmam氏综合症、雄激素受体缺乏所表现的男性假两性畸形等。
肾上腺疾病：阿狄森氏病（ Addison’’s病）、柯兴氏综合症、女性化肾上腺皮质肿瘤、先天性肾上腺增生症、醛固酮增多症等疾病，均可造成男性不育。
甲状腺疾病：严重的甲状腺功能低下或甲状腺功能亢进，均可影响生殖功能。甲状腺功能低下时，睾酮合成减少，精子生成受到抑制，并发生性功能紊乱。甲状腺功能亢进时常伴有男性乳房发育、性欲减退、阳痿等。
